Balayının romantik rüyasından uyanan Shrek ve Fiona, bekleyen bir sürprizle karşılaşırlar: Fiona'nın ailesinden gelen bir davet. Uzaklardaki Uzak Ülke'nin hükümdarı, Kral babası ve Kraliçe annesi, kızlarının dönüşünü ve damatlarını tanımayı sabırsızlıkla beklemektedirler. Shrek, Fiona ve hiç yalnız bırakmadıkları geveze dostları Eşek, Uzak Ülke'ye doğru uzun bir yolculuğa çıkarlar.
Uzak Ülke, prensesin dönüşüyle coşkuyla dolup taşar. Halk sokaklara dökülmüş, bayraklar dalgalanmakta, müzik her yanı sarmaktadır. Ancak kraliyet ailesinin heyecanı, Shrek'in beklenmedik görüntüsüyle gölgelenir. Kral, kızının seçimi karşısında şaşkınlığa düşerken, Fiona'nın da eski halinden çok farklı olduğunu fark eder. Bu evlilik, Kral'ın geleceğe dair kurduğu tüm planları alt üst etmiştir.
Kral, umutsuzca durumu düzeltmek için gizli planlar yapmaya başlar. Peri Vaftiz Annesi'nden, her zaman yakışıklı ve çekici olan oğlundan ve efsanevi canavar avcısı Çizmeli Kedi'den yardım ister. Bilmedikleri sırlar ve ihanetlerle dolu bu masalsı krallıkta, Shrek ve Fiona aşklarını ve mutluluklarını korumak için zorlu bir mücadele vermek zorunda kalacaklardır. Uzak Ülke'nin parıltılı yüzeyinin altında, entrika ve sihir dolu bir savaş başlamak üzeredir.
