Okyanusun derinliklerinde, biricik eşini daha dünyaya gelir gelmez kaybeden Marlin, minik oğlu Nemo'ya hem anne hem de baba olmuştu. Aşırı korumacı tavırları, Nemo'nun okul çağına gelmesiyle birlikte genç balığın özgürlük arayışıyla çatışmaya başlar. Marlin'in en büyük korkusu, ufacık bedeninin sığamadığı okyanus akıntıları ve bilinmez tehlikelerdir. Bu yüzden Nemo'ya okyanusta yüzmeyi yasaklamış, onu her zaman kanatları altına almaya çalışmıştır. Ancak Nemo, babasının bu aşırı ilgisinden bunalır ve bir gün, okyanus yüzeyinde parıldayan gizemli bir cisme dokunma cesaretini gösterir. Bu cesaret, onu bir anda insan ellerine teslim eder. Oğlu gözlerinin önünde kaçırılan Marlin için artık hayat, tek bir amaca odaklanmıştır: Nemo'yu bulmak ve onu eve geri getirmek. Ancak okyanus, sandığından çok daha büyük ve tehlikelidir. Marlin, Nemo'yu kurtarmak için çıktığı bu epik yolculukta, dostluklar kuracak, korkularıyla yüzleşecek ve belki de en önemlisi, babalık kavramının gerçek anlamını yeniden keşfedecektir. Bu arayış, sadece Nemo'yu değil, Marlin'i de bambaşka birine dönüştürecektir.
