Sam Witwicky'nin hayatı, sıradan bir gençlik hayallerinden çok uzak, galaksiler arası bir satranç oyununun tam ortasına sürükleniyor. Bu kez, Transformers'ların sadece dünyadaki varlıklarının değil, kökenlerinin de derinliklerine inen şifreli bir bilginin anahtarını elinde tutuyor. Ancak bu bilgi, karanlık niyetli Decepticon'lar için de karşı konulmaz bir arzu nesnesi haline geliyor. Sam, geçmişin sırlarını açığa çıkardıkça, Decepticon'ların acımasız takibi de yoğunlaşıyor ve onu nefes kesen bir kovalamacanın içine sürüklüyor.
Kaderin cilvesiyle, bu epik mücadele, antik gizemlerin ve modern teknolojinin kesişim noktası olan Mısır'ın kadim topraklarına, Giza piramitlerinin gölgesine taşınıyor. Piramitlerin altında, binlerce yıldır saklı kalmış bir tapınak yatıyor ve bu tapınak, Transformers'ların geleceğini şekillendirecek, hatta evrenin kaderini değiştirebilecek sırları barındırıyor. Sam, Autobot müttefikleriyle birlikte, Decepticon'ların hain planlarını bozmak ve bu kadim tapınağın sırlarını korumak için zamana karşı amansız bir yarışa giriyor. Mısır'ın kızgın güneşinin altında, Transformers'ların destansı savaşı, insanlığın geleceği için verilen bir umut mücadelesine dönüşüyor.
